Comparaison de la physiologie des communautés bactériennes associées aux copépodes isolées de différents environnements marins

Abstract

Ce mémoire explore la diversité et la physiologie des communautés bactériennes associées à deux espèces de copépodes marins, Acartia tonsa et Centropages typicus, prélevées respectivement près d’une station de dessalement et d’une ferme aquacole en Algérie. L’étude vise à comprendre comment les pressions anthropiques influencent les interactions hôtemicrobiome dans ces environnements côtiers. Une série d’analyses microbiologiques a été conduite sur les compartiments endo- et exo-biotiques des copépodes : dénombrement bactérien, caractérisation phénotypique, tests enzymatiques (protéase, uréase, phosphatase, amylase), coloration de Gram, test de catalase et tolérance à la salinité. Les résultats montrent une diversité significative de communautés bactériennes associées à Centropages typicus et Acartia tonsa, avec des adaptations morphologiques et physiologiques spécifiques aux environnements endobiotiques et exobiotiques. Une densité bactérienne plus élevée chez C. typicus, particulièrement au niveau exo-biotique, tandis que les bactéries associées à A. tonsa montrent une plus grande tolérance à la salinité, en cohérence avec son habitat plus variable. Les analyses enzymatiques ont mis en évidence des capacités métaboliques différenciées entre les isolats, avec une activité amylasique plus fréquente et une production d’uréase significative dans certaines souches. La majorité des isolats étaient Grampositifs, à morphologie coccobacillaire. Cette étude souligne l’influence de l’environnement sur la composition et les propriétés fonctionnelles des microbiomes copépodiques, apportant un éclairage pertinent sur leur rôle écologique et leur potentiel biotechnologique dans les écosystèmes marins méditerranéens