Polycopié de cours de Microbiologie de l’environnement

Abstract

La microbiologie de l’environnement consiste à l’étude de la biodiversité microbienne d’un écosystème et la place et le rôle des microorganismes dans un habitat (environnement) ainsi que les interactions des microorganismes entre eux et avec leur milieu. Ce polycopié est destiné aux étudiants de Licence en Microbiologie Appliquée et toute personne qui s’intéresse à la microbiologie. Il est constitué de cinq chapitres, le premier chapitre concerne les interactions des microorganismes entre eux et avec d’autres composants d’un écosystème, l’étude de la diversité, la densité et le fonctionnement des microorganismes dans leurs habitats (environnement). Ce chapitre est une introduction à tous les chapitres suivants. Le second chapitre est consacré aux microorganismes habitant les systèmes aquatiques que soit les eaux douces ou les eaux salines. Le chapitre trois concerne les milieux terrestre, il est réparti en trois grandes parties : Le sol, la rhizosphère et l’endosphère. Le quatrième chapitre s’intéresse à l’environnement de l’air ou l’analyse de la composante microbienne de l’ambiance représenté par l’air intérieur. Le dernier chapitre est consacré au microbiote intestinal, sa composition, son rôle et son effet sur la santé de l’homme.