Caractérisation moléculaire des isolats de Klebsiella pneumoniae des prélèvements cliniques à Médéa

Abstract

Klebsiella pneumoniae est une entérobactérie pathogène opportuniste exprimant divers facteurs de virulence et de résistance et capable d’acquérir facilement la multirésistance aux antibiotiques. Cette étude a été réalisé sur 30 souches de Klebsiella pneumoniae isolée à partir d’examen cytobactériologie des urines (ECBU), durant la période de 06 décembre a 03 mai, proviennent des infections communautaires, avec des caractères phénotypiques déjà effectués. Ces 30 souches ont fait l’objet d’extraction qui a été réalisé par une technique manuelle chimique. Les gènes de résistance (TEM, tetA, sul1, qnr, dfrA1, aac(3)-II) et de virulence ( iroN, irp2, cnf1) ont été détectés par la technique de PCR conventionnelle, et pour les BLSE en utilisant des amorces spécifiques pour le type TEM. Cette étude montre que, le sexe féminin est le plus prédisposé a attrapée des infections urinaires par K. pneumoniae avec un taux de 86%. Alors que le tranche d’âge, oscillent entre 20-45 ans. Dans ce contexte, les résultats ont montré qu’il y a une résistance accrue vis-à vis a amoxicilline (69,59%) et le cotrimoxazole (39,36%) et une sensibilité de 100% pour l’imipenème, colistine et l’amikacine. La détection des gènes de résistances a révélé l’occurrences des souches porteuses du gène TEM avec 44%, 10% au aac(3)-II, et 0% pour (tetA, sul1, qnr, dfrA1). Alors que les souches ont montré que les gènes de virulence ont été présent avec : 15% pour l’iroN, et 0% pour irp2 et cnf1. Par ailleurs, nos souches ont été classifiés en 5 clades, parmi lesquelles le clade 1 (40%) et 4 (36,66%) sont les plus dominants. Alors que les autres clades : 2 (6,66%), 3 (6,66%), et 5 (10%) sont des clades émergeants. Cette étude a montré la domination des souches porteuses du gène TEM, et l’émergence des souches porteuse des gènes aac(3)-II et iroN