Approche comparative in silico entre les differentes agonistes de la voie anti-inflammatoire cholinergique alpha 7

Abstract

Dans le contexte de l’identification et l’optimisation de l’utilisation de nouvelles molécules antiinflammatoires à intérêt thérapeutique, nous avons réalisé dans ce travail une comparaison In Silico de 13 ligands du récepteur nicotinique alpha 7 (α7 nAchR). Ce dernier est l’élément clé de la voie anti-inflammatoire cholinergique qui demeure une piste prometteuse dans le traitement de plusieurs maladies inflammatoire chronique Pour cela, nous avons collecté les 13 ligands de la banque des données « PubChem » et le récepteur α7 nAchR de la banque des protéines « PDB ». Sur le plan pratique, nous avons tout d’abord réalisé une analyse des caractéristiques physico-chimiques et une prédiction des effets biologiques sur les portails web « Molinspiration » et « SwissADME ». De plus, nous avons utilisé la plateforme PASS afin de prédire l’intérêt thérapeutique des 13 molécules étudiées. Enfin, nous avons réalisé une série de docking moléculaire des molécules sélectionnées au récepteur α7 nAchR sur l’outil « CB-DOCK2 » et analysé les données sur le programme « DISCOVERY ». Nous résultats confirment que les deux agonistes GTS-21 et le PNU282987 sont les deux molécules qui respectent les conditions de la règle de Lipinski avec des caractéristiques physicochimiques qui leurs qualifient comme drug-like. Cependant, l’antagoniste alpha-bungarotoxin et les deux agonistes Semapimod hydrochloride et [3H]methyllycaconitine ne respectent pas les conditions de caractérisation et d’identification des molécules à intérêt thérapeutique. Les données du docking moléculaire rejoint les données précédentes, la GTS-21 et le PNU282987 présentent les meilleures affinités au récepteur α7 nAchR ce qui suppose que leur effet biologique et leur intérêt thérapeutique sont conditionnés par cette voie cholinergique anti-inflammatoire. Ces résultats représentent la première investigation In silico de ces molécules qui proposent la GTS-21 et le PNU-282987 comme nouvelles molécules à intérêt thérapeutique