Criblage virtuel des composés phytochimiques dans le but d’identifier de nouveaux composés antiviraux contre le SARS-COV-2

Abstract

La propagation rapide du nouveau coronavirus (SARS-COV-2) comme une menace sérieuse pour la santé publique mondiale a besoin de trouver des agents thérapeutiques potentiels. La protéase principale (3CLpro) est l'une des cibles de médicament vitales parmi tous les coronavirus, car la protéine est indispensable pour le virus. Les composés naturels sont largement reconnus comme source de drogues antivirales en raison de leur diversité structurelle et de leur sécurité. Dans cette étude, nous avons utilisé la stratégie de criblage virtuel sur le Docking moléculaire pour étudier les interactions de 1000 composés naturels ayant des propriétés antivirales avec 3CLpro ciblée de coronavirus en utilisant le programme MEO, Notre étude a révélé que 3 composés ayant des scores d'affinité les plus élevées par rapport aux autres composés, avec des scores de Docking allant de (-5,443 kcal à -5.218 kcal / mol). Aussi nous avons déterminé les propriétés drug likeness pour les composés sélectionnés. Cette étude entraîne l'identification de trois composés 1, 2 et 3 conformément à la règle de Lipinski ainsi que la règle Veber. Nous avons montré que ces quatre composes présentent un intérêt comme point de départ pour la conception des inhibiteurs de SARS-CoV-2. Ces composés peuvent être évalués pour leurs activités inhibitrices à l'aide des techniques expérimentales