Utilisation de la méthode QSAR –SVMDA et le Docking pour la prédiction de l’activité inhibitrice des inhibiteurs et l’évaluation des interactions entre le récepteur et le ligand du Cancer de la peau

Abstract

Ce projet de fin d’études se concentre sur l’exploration de nouveaux médicaments pour le mélanome, en développant un modèle QSAR permettant de corréler la structure des molécules avec leur activité, notamment le pGI50. L’algorithme SVM_DA a été appliqué pour réaliser cette tâche. L’algorithme Stepwise a été utilisé pour obtenir les descripteurs représentatifs de la base de données sélectionnée en fonction de sa nouveauté et de son activité avérée. Le modèle construit a été évalué et comparé en utilisant différents critères internes et de validation externe, tout en déterminant le domaine d’application spécifique du modèle. Le modèle SVM_DA a démontré une capacité prédictive et une robustesse exceptionnelle, avec des critères de R2:[ 0,9613 0,8230, 0,9428 ] et RMSE=0,37 Par ailleurs, le Swiss ADME a été utilisé pour obtenir les paramètres Pharmacologiques, tandis que l’ADMET Lab 2.0 a été employé pour évaluer les paramètres de toxicité. En complément, le docking par Ubuntu a été effectué afin d’étudier les interactions entre les molécules et la cible