Isolement, caractérisation phénotypique et évaluation de l’effet antagoniste des souches isolées à partir du sol agricole

Abstract

Ces dernières années, le monde a été témoin d‟une grande diversité de micro-organismes dont le plus important est peut-être les bactéries. Les bactéries peuvent causer des dommages au niveau des cultures. La détection rapide de certaine de ces agents phytopathogènes est indispensables pour avoir une lutte efficace, la détection passe d‟abord par un bon échantillonnage du milieu à analyser « le sol », suivi par des tests d‟identification indirecte qui demande un isolement préalable des bactéries sur des milieux gélosé « purification », les galeries API 20E, API 20 NE, API STaph sont sur le point de s‟assurer des résultats. Après avoir identifié les souches bactériennes nous avons étudié l‟effet antagoniste de ces souches bactériennes entre aux et sur l‟agent phytopathogènes : Fusarium oxysporum et ceci par des confrontations in vitro (méthodes directe). La caractérisation phénotypique des souches isolées à base de leurs propriétés macroscopiques, microscopiques et biochimiques nous a permis d'isoler 29 souches appartenant aux genres Bacillus, Pseudomonas, Staphylococus, Entérobactère, Burkholderia. L‟effet de l‟antagonisme nous a permis de trouver un effet positif de la souche P. aerugenosa utilisé avait d‟activité inhibitrice contre les bactéries pathogène (A .hydrophila, Enterobacter Sakazaki, S. Xylosus, Burkholderia cepacia). Le pourcentage d‟inhibition de la croissance mycélienne de le F. oxysporum varie d‟une souche bactérienne à une autre, Les souches (OB3, OB2, TA9, OB1) ont révélées respectivement les pourcentages suivants (45.45%, 41.81% et 32.72% et18.18 %. les taux d‟inhibions de la croissance fongique les plus élevés ont été marqué par la bactérie Serratia rubidaea OB3